В системах , использующихся для анализов на установление родства нет "определяющих" локусов. Заключение делается исходя из данных, полученных по всей совокупности локусов. Если по ВСЕМ локусам системы получены данные, не противоречащие отцовству, то делается заключение об истинности отцовства и расчитываются вероятностные характеристики данного заключения.
Существуют два основных подхода к оценке достоверности полученного результата.
При первом, рассчитывается вероятность того, что совпадение по всем локусам произошло случайно. Другими словами, это вероятность того, что при данных генотипах матери и ребенка, любой, взятый наугад мужчина (не являющийся родным отцом ребенка) даст, при проведении анализа по данной системе локусов, несовпадение хотя бы по одному локусу. Однако несовпадение по какому-либо локусу может быть обусловлено не только тем, что мужчина не является родным отцом ребенка, но и мутацией, произошедшей в половых клетках мужчины в период сперматогенеза. В таком случае отец может передать ребенку аллель, не совпадающий ни с одним из аллелей данного локуса, содержащихся в его (отца) соматических клетках. Вероятность мутации для различных локусов различна, но в среднем составляет величину порядка 0,001. При рассматриваемом подходе к оценке достоверности заключения невозможно количественно учесть вероятности мутаций, поэтому договорились считать, что при наличии несовпадений по не менее чем трём локусам, считается доказанным, что мужчина не является родным отцом ребенка. В случае несовпадения по одному или по двум локусам сказать что-то определенное нельзя. В таких случаях анализируются дополнительные локусы.
При втором подходе расчитывается вероятность того, что мужчина является родным отцом ребенка, при условии, что мужчина, мать и ребенок имеют генотипы, выявленные в результате проведенного исследования. При расчете используется формула Байеса из теории вероятностей. В формулу входит величина , называемая ИНДЕКСОМ ОТЦОВСТВА, которая представляет собой отношение вероятности наблюдать полученную совокупность генотипов мужчины, матери и ребенка при условии. что мужчина родной отец ребенка, к той же вероятности, но при условии. что родным отцом ребенка является неизвестный мужчина. Индекс отцовства по совокупности локусов является произведением индексов отцовства для отдельных локусов. При данном подходе становится возможным учесть вероятность мутации в локусе, то есть расчитать индекс отцовства для локусов, по которым наблюдается несовпадение. В настоящее время, существуют несколько подходов к расчету индекса отцовства для таких локусов, все дают примерно равные величины.
В Вашем случае, нужно знать, какую вероятность расчитывают в лаборатории, проводившей анализ, по каким локусам есть несовпадение, и каков характер различия в аллелях ребенка и предполагаемого отца.